EVODEX Logo

EVODEX.1-R391

Full Hydrogen-Mapped Reaction

SMIRKS

Reaction Rendering

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:28][C:26]([C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25])=[O:27].[O:29]=[O:30]>>[C:26](=[O:27])=[O:28].[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:30][C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25]

Source Database Data

Rxn Index Original Reaction Text Natural Organism Protein Refs Protein DB EC Number
43380 thymidine + 2-oxoglutarate + O2 = 5-hydroxymethyluridine + succinate + CO2 True Trypanosoma brucei nan 1.14.11.3

Derived Partial Reactions

EVODEX.1-P395

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:28][C:26]([C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25])=[O:27].[O:29]=[O:30]>>[C:26](=[O:27])=[O:28].[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:30][C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25]

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:28][C:26]([C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25])=[O:27].[O:29]=[O:30]>>[C:26](=[O:27])=[O:28].[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:30][C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25]

EVODEX.1-P396

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H]OC(=O)[C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25].[O:29]=[O:30]>>[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:30][C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25]

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H]OC(=O)[C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25].[O:29]=[O:30]>>[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H][O:30][C:24]([C:23]([C:22]([C:20](=[O:19])[O:21][H:45])([H:49])[H:50])([H:47])[H:48])=[O:25]

EVODEX.1-P397

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[O:29]=[O:30]>>[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H]OC(=O)C([H])([H])C([H])([H])C(=O)[O:30][H]

[H][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[O:29]=[O:30]>>[H][O:29][C:1]([C:2]1:[C:3]([H:31]):[N:4]([C@:5]2([H:32])[O:6][C@@:7]([C:8]([O:9][H:33])([H:34])[H:35])([H:36])[C@:10]([O:11][H:37])([H:38])[C@@:12]2([O:13][H:39])[H:40]):[C:14](=[O:15]):[N:16]([H:41]):[C:17]:1=[O:18])([H:42])[H:43].[H]OC(=O)C([H])([H])C([H])([H])C(=O)[O:30][H]