EVODEX Logo

EVODEX.1-R7433

Full Hydrogen-Mapped Reaction

SMIRKS

Reaction Rendering

[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:122])([H:123])[H:124])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:121])=[O:39])[H:120])([H:118])[H:119])([H:116])[H:117])=[O:44])[H:115])([H:113])[H:114])([H:111])[H:112].[N:49]([C:50]1:[N:51]:[C:52]2:[C:53](:[N:54]:[C:55]([H:125]):[N:56]:2[C@:57]2([H:126])[O:58][C@@:59]([C:60]([O:61][P:62](=[O:63])([O:64][H:127])[O:65][P:66](=[O:67])([O:68][H:128])[O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130])([H:131])[H:132])([H:133])[C@:74]([O:75][H:134])([H:135])[C@:76]2([O:77][H:136])[H:137]):[C:78](=[O:79]):[N:80]:1[H:138])([H:139])[H:140].[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[H:115])([H:116])[H:117])([H:118])[H:119])[H:120])[H:121])([H:122])([H:123])[H:124].[N:49]([C:50]1:[N:51]:[C:52]2:[C:53](:[N:54]:[C:55]([H:125]):[N:56]:2[C@:57]2([H:126])[O:58][C@@:59]([C:60]([O:61][P:62](=[O:63])([O:64][H:127])[O:65][P:66](=[O:67])([O:68][H:128])[O:83][H:141])([H:131])[H:132])([H:133])[C@:74]([O:75][H:134])([H:135])[C@:76]2([O:77][H:136])[H:137]):[C:78](=[O:79]):[N:80]:1[H:138])([H:139])[H:140].[H][O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130]

Source Database Data

Rxn Index Original Reaction Text Natural Organism Protein Refs Protein DB EC Number
317181 GTP + succinate + CoA = GDP + phosphate + succinyl-CoA {r} True Thermus aquaticus nan 6.2.1.4

Derived Partial Reactions

EVODEX.1-P6821

[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:122])([H:123])[H:124])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:121])=[O:39])[H:120])([H:118])[H:119])([H:116])[H:117])=[O:44])[H:115])([H:113])[H:114])([H:111])[H:112].[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130].[H]O[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[H:115])([H:116])[H:117])([H:118])[H:119])[H:120])[H:121])([H:122])([H:123])[H:124].[H][O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130]

[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:122])([H:123])[H:124])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:121])=[O:39])[H:120])([H:118])[H:119])([H:116])[H:117])=[O:44])[H:115])([H:113])[H:114])([H:111])[H:112].[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130].[H]O[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[H:115])([H:116])[H:117])([H:118])[H:119])[H:120])[H:121])([H:122])([H:123])[H:124].[H][O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130]

EVODEX.1-P6822

[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:122])([H:123])[H:124])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:121])=[O:39])[H:120])([H:118])[H:119])([H:116])[H:117])=[O:44])[H:115])([H:113])[H:114])([H:111])[H:112].[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[H:115])([H:116])[H:117])([H:118])[H:119])[H:120])[H:121])([H:122])([H:123])[H:124].[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:83][H:141]

[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:122])([H:123])[H:124])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:121])=[O:39])[H:120])([H:118])[H:119])([H:116])[H:117])=[O:44])[H:115])([H:113])[H:114])([H:111])[H:112].[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[H:115])([H:116])[H:117])([H:118])[H:119])[H:120])[H:121])([H:122])([H:123])[H:124].[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:83][H:141]

EVODEX.1-P6823

[H]OP(=O)(O[H])O[P:66]([O:65][P:62]([O:61][C:60]([C@@:59]1([H:133])[O:58][C@:57]([N:56]2:[C:52]3:[N:51]:[C:50]([N:49]([H:139])[H:140]):[N:80]([H:138]):[C:78](=[O:79]):[C:53]:3:[N:54]:[C:55]:2[H:125])([H:126])[C@@:76]([O:77][H:136])([H:137])[C@@:74]1([O:75][H:134])[H:135])([H:131])[H:132])(=[O:63])[O:64][H:127])(=[O:67])[O:68][H:128].[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[N:49]([C:50]1:[N:51]:[C:52]2:[C:53](:[N:54]:[C:55]([H:125]):[N:56]:2[C@:57]2([H:126])[O:58][C@@:59]([C:60]([O:61][P:62](=[O:63])([O:64][H:127])[O:65][P:66](=[O:67])([O:68][H:128])[O:83][H:141])([H:131])[H:132])([H:133])[C@:74]([O:75][H:134])([H:135])[C@:76]2([O:77][H:136])[H:137]):[C:78](=[O:79]):[N:80]:1[H:138])([H:139])[H:140]

[H]OP(=O)(O[H])O[P:66]([O:65][P:62]([O:61][C:60]([C@@:59]1([H:133])[O:58][C@:57]([N:56]2:[C:52]3:[N:51]:[C:50]([N:49]([H:139])[H:140]):[N:80]([H:138]):[C:78](=[O:79]):[C:53]:3:[N:54]:[C:55]:2[H:125])([H:126])[C@@:76]([O:77][H:136])([H:137])[C@@:74]1([O:75][H:134])[H:135])([H:131])[H:132])(=[O:63])[O:64][H:127])(=[O:67])[O:68][H:128].[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[N:49]([C:50]1:[N:51]:[C:52]2:[C:53](:[N:54]:[C:55]([H:125]):[N:56]:2[C@:57]2([H:126])[O:58][C@@:59]([C:60]([O:61][P:62](=[O:63])([O:64][H:127])[O:65][P:66](=[O:67])([O:68][H:128])[O:83][H:141])([H:131])[H:132])([H:133])[C@:74]([O:75][H:134])([H:135])[C@:76]2([O:77][H:136])[H:137]):[C:78](=[O:79]):[N:80]:1[H:138])([H:139])[H:140]

EVODEX.1-P6824

[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130].[H]O[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[H][O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130]

[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130].[H]O[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[H][O:69][P:70](=[O:71])([O:72][H:129])[O:73][H:130]

EVODEX.1-P6825

[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:83][H:141]

[O:81]=[C:82]([O:83][H:141])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146]>>[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:82](=[O:81])[C:84]([C:85]([C:86](=[O:87])[O:88][H:142])([H:143])[H:144])([H:145])[H:146])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[H]O[C@@]1([H])[C@@]([H])(O[H])[C@]([H])(N2:C([H]):N:C3:C(=O):N([H]):C(N([H])[H]):N:C:3:2)O[C@]1([H])C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])[O:83][H:141]