EVODEX Logo

EVODEX.1-R7434

Full Hydrogen-Mapped Reaction

SMIRKS

Reaction Rendering

[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:49](=[O:50])[C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])([H:115])[H:116])([H:117])[H:118])[H:119])([H:120])[H:121])([H:122])[H:123])[H:124])[H:125])([H:126])([H:127])[H:128].[N:56]([C:57]1:[N:58]:[C:59]2:[C:60](:[N:61]:[C:62]([H:129]):[N:63]:2[C@:64]2([H:130])[O:65][C@@:66]([C:67]([O:68][P:69](=[O:70])([O:71][H:131])[O:72][P:73](=[O:74])([O:75][H:132])[O:76][H:133])([H:134])[H:135])([H:136])[C@:77]([O:78][H:137])([H:138])[C@:79]2([O:80][H:139])[H:140]):[C:81](=[O:82]):[N:83]:1[H:141])([H:142])[H:143].[H][O:86][P:85](=[O:84])([O:87][H:145])[O:88][H:146]>>[C:49](=[O:50])([C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[O:75][H:132].[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:126])([H:127])[H:128])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:125])=[O:39])[H:124])([H:122])[H:123])([H:120])[H:121])=[O:44])[H:119])([H:117])[H:118])([H:115])[H:116].[N:56]([C:57]1:[N:58]:[C:59]2:[C:60](:[N:61]:[C:62]([H:129]):[N:63]:2[C@:64]2([H:130])[O:65][C@@:66]([C:67]([O:68][P:69](=[O:70])([O:71][H:131])[O:72][P:73](=[O:74])([O:76][H:133])[O:86][P:85](=[O:84])([O:87][H:145])[O:88][H:146])([H:134])[H:135])([H:136])[C@:77]([O:78][H:137])([H:138])[C@:79]2([O:80][H:139])[H:140]):[C:81](=[O:82]):[N:83]:1[H:141])([H:142])[H:143]

Source Database Data

Rxn Index Original Reaction Text Natural Organism Protein Refs Protein DB EC Number
317181 GTP + succinate + CoA = GDP + phosphate + succinyl-CoA {r} True Thermus aquaticus nan 6.2.1.4

Derived Partial Reactions

EVODEX.1-P2219

[H]O[P:69]([O:68][P:65]([O:64][C:63]([C@@:62]1([H:139])[O:61][C@:60]([N:59]2:[C:55]3:[N:54]:[C:53]([N:52]([H:145])[H:146]):[N:79]([H:144]):[C:77](=[O:78]):[C:56]:3:[N:57]:[C:58]:2[H:132])([H:133])[C@@:75]([O:76][H:142])([H:143])[C@@:73]1([O:74][H:140])[H:141])([H:137])[H:138])(=[O:66])[O:67][H:134])(=[O:70])[O:72][H:136].[H][O:91][P:90](=[O:89])([O:92][H:152])[O:93][H:153]>>[N:52]([C:53]1:[N:54]:[C:55]2:[C:56](:[N:57]:[C:58]([H:132]):[N:59]:2[C@:60]2([H:133])[O:61][C@@:62]([C:63]([O:64][P:65](=[O:66])([O:67][H:134])[O:68][P:69](=[O:70])([O:72][H:136])[O:91][P:90](=[O:89])([O:92][H:152])[O:93][H:153])([H:137])[H:138])([H:139])[C@:73]([O:74][H:140])([H:141])[C@:75]2([O:76][H:142])[H:143]):[C:77](=[O:78]):[N:79]:1[H:144])([H:145])[H:146]

[H]O[P:69]([O:68][P:65]([O:64][C:63]([C@@:62]1([H:139])[O:61][C@:60]([N:59]2:[C:55]3:[N:54]:[C:53]([N:52]([H:145])[H:146]):[N:79]([H:144]):[C:77](=[O:78]):[C:56]:3:[N:57]:[C:58]:2[H:132])([H:133])[C@@:75]([O:76][H:142])([H:143])[C@@:73]1([O:74][H:140])[H:141])([H:137])[H:138])(=[O:66])[O:67][H:134])(=[O:70])[O:72][H:136].[H][O:91][P:90](=[O:89])([O:92][H:152])[O:93][H:153]>>[N:52]([C:53]1:[N:54]:[C:55]2:[C:56](:[N:57]:[C:58]([H:132]):[N:59]:2[C@:60]2([H:133])[O:61][C@@:62]([C:63]([O:64][P:65](=[O:66])([O:67][H:134])[O:68][P:69](=[O:70])([O:72][H:136])[O:91][P:90](=[O:89])([O:92][H:152])[O:93][H:153])([H:137])[H:138])([H:139])[C@:73]([O:74][H:140])([H:141])[C@:75]2([O:76][H:142])[H:143]):[C:77](=[O:78]):[N:79]:1[H:144])([H:145])[H:146]

EVODEX.1-P6826

[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:49](=[O:50])[C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])([H:115])[H:116])([H:117])[H:118])[H:119])([H:120])[H:121])([H:122])[H:123])[H:124])[H:125])([H:126])([H:127])[H:128].[N:56]([C:57]1:[N:58]:[C:59]2:[C:60](:[N:61]:[C:62]([H:129]):[N:63]:2[C@:64]2([H:130])[O:65][C@@:66]([C:67]([O:68][P:69](=[O:70])([O:71][H:131])[O:72][P:73](=[O:74])([O:75][H:132])[O:76][H:133])([H:134])[H:135])([H:136])[C@:77]([O:78][H:137])([H:138])[C@:79]2([O:80][H:139])[H:140]):[C:81](=[O:82]):[N:83]:1[H:141])([H:142])[H:143]>>[C:49](=[O:50])([C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[O:75][H:132].[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:126])([H:127])[H:128])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:125])=[O:39])[H:124])([H:122])[H:123])([H:120])[H:121])=[O:44])[H:119])([H:117])[H:118])([H:115])[H:116].[H]OP(=O)(O[H])O[P:73]([O:72][P:69]([O:68][C:67]([C@@:66]1([H:136])[O:65][C@:64]([N:63]2:[C:59]3:[N:58]:[C:57]([N:56]([H:142])[H:143]):[N:83]([H:141]):[C:81](=[O:82]):[C:60]:3:[N:61]:[C:62]:2[H:129])([H:130])[C@@:79]([O:80][H:139])([H:140])[C@@:77]1([O:78][H:137])[H:138])([H:134])[H:135])(=[O:70])[O:71][H:131])(=[O:74])[O:76][H:133]

[C:1]([C:2]([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])([C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])[C@@:36]([O:37][H:109])([C:38](=[O:39])[N:40]([C:41]([C:42]([C:43](=[O:44])[N:45]([C:46]([C:47]([S:48][C:49](=[O:50])[C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])([H:115])[H:116])([H:117])[H:118])[H:119])([H:120])[H:121])([H:122])[H:123])[H:124])[H:125])([H:126])([H:127])[H:128].[N:56]([C:57]1:[N:58]:[C:59]2:[C:60](:[N:61]:[C:62]([H:129]):[N:63]:2[C@:64]2([H:130])[O:65][C@@:66]([C:67]([O:68][P:69](=[O:70])([O:71][H:131])[O:72][P:73](=[O:74])([O:75][H:132])[O:76][H:133])([H:134])[H:135])([H:136])[C@:77]([O:78][H:137])([H:138])[C@:79]2([O:80][H:139])[H:140]):[C:81](=[O:82]):[N:83]:1[H:141])([H:142])[H:143]>>[C:49](=[O:50])([C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[O:75][H:132].[H][S:48][C:47]([C:46]([N:45]([C:43]([C:42]([C:41]([N:40]([C:38]([C@@:36]([C:2]([C:1]([H:126])([H:127])[H:128])([C:3]([H:89])([H:90])[H:91])[C:4]([O:5][P:6](=[O:7])([O:8][H:92])[O:9][P:10](=[O:11])([O:12][H:93])[O:13][C:14]([C@@:15]1([H:94])[O:16][C@:17]([N:18]2:[C:19]([H:95]):[N:20]:[C:21]3:[C:22]([N:23]([H:96])[H:97]):[N:24]:[C:25]([H:98]):[N:26]:[C:27]:2:3)([H:99])[C@@:28]([O:29][H:100])([H:101])[C@@:30]1([O:31][P:32](=[O:33])([O:34][H:102])[O:35][H:103])[H:104])([H:105])[H:106])([H:107])[H:108])([O:37][H:109])[H:125])=[O:39])[H:124])([H:122])[H:123])([H:120])[H:121])=[O:44])[H:119])([H:117])[H:118])([H:115])[H:116].[H]OP(=O)(O[H])O[P:73]([O:72][P:69]([O:68][C:67]([C@@:66]1([H:136])[O:65][C@:64]([N:63]2:[C:59]3:[N:58]:[C:57]([N:56]([H:142])[H:143]):[N:83]([H:141]):[C:81](=[O:82]):[C:60]:3:[N:61]:[C:62]:2[H:129])([H:130])[C@@:79]([O:80][H:139])([H:140])[C@@:77]1([O:78][H:137])[H:138])([H:134])[H:135])(=[O:70])[O:71][H:131])(=[O:74])[O:76][H:133]

EVODEX.1-P6827

[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:49](=[O:50])[C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[N:56]([C:57]1:[N:58]:[C:59]2:[C:60](:[N:61]:[C:62]([H:129]):[N:63]:2[C@:64]2([H:130])[O:65][C@@:66]([C:67]([O:68][P:69](=[O:70])([O:71][H:131])[O:72][P:73](=[O:74])([O:75][H:132])[O:76][H:133])([H:134])[H:135])([H:136])[C@:77]([O:78][H:137])([H:138])[C@:79]2([O:80][H:139])[H:140]):[C:81](=[O:82]):[N:83]:1[H:141])([H:142])[H:143]>>[C:49](=[O:50])([C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[O:75][H:132].[H]OP(=O)(O[H])O[P:73]([O:72][P:69]([O:68][C:67]([C@@:66]1([H:136])[O:65][C@:64]([N:63]2:[C:59]3:[N:58]:[C:57]([N:56]([H:142])[H:143]):[N:83]([H:141]):[C:81](=[O:82]):[C:60]:3:[N:61]:[C:62]:2[H:129])([H:130])[C@@:79]([O:80][H:139])([H:140])[C@@:77]1([O:78][H:137])[H:138])([H:134])[H:135])(=[O:70])[O:71][H:131])(=[O:74])[O:76][H:133]

[H]O[C@]1([H])[C@]([H])(OP(=O)(O[H])O[H])[C@@]([H])(C([H])([H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OC([H])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[C@@]([H])(O[H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])C([H])([H])C([H])([H])S[C:49](=[O:50])[C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])O[C@@]1([H])N1:C([H]):N:C2:C(N([H])[H]):N:C([H]):N:C:2:1.[N:56]([C:57]1:[N:58]:[C:59]2:[C:60](:[N:61]:[C:62]([H:129]):[N:63]:2[C@:64]2([H:130])[O:65][C@@:66]([C:67]([O:68][P:69](=[O:70])([O:71][H:131])[O:72][P:73](=[O:74])([O:75][H:132])[O:76][H:133])([H:134])[H:135])([H:136])[C@:77]([O:78][H:137])([H:138])[C@:79]2([O:80][H:139])[H:140]):[C:81](=[O:82]):[N:83]:1[H:141])([H:142])[H:143]>>[C:49](=[O:50])([C:51]([C:52]([C:53](=[O:54])[O:55][H:110])([H:111])[H:112])([H:113])[H:114])[O:75][H:132].[H]OP(=O)(O[H])O[P:73]([O:72][P:69]([O:68][C:67]([C@@:66]1([H:136])[O:65][C@:64]([N:63]2:[C:59]3:[N:58]:[C:57]([N:56]([H:142])[H:143]):[N:83]([H:141]):[C:81](=[O:82]):[C:60]:3:[N:61]:[C:62]:2[H:129])([H:130])[C@@:79]([O:80][H:139])([H:140])[C@@:77]1([O:78][H:137])[H:138])([H:134])[H:135])(=[O:70])[O:71][H:131])(=[O:74])[O:76][H:133]